进京施工备案办理过程中，环境管理体系认证证书的检查是确保施工单位对环境管理具备一定标准和体系的重要环节。这些认证证书通常包括以下内容：

ISO 14001环境管理体系认证证书：这是国际上广泛认可的环境管理体系认证标准，证明施工单位的环境管理体系符合ISO 14001标准的要求。

环境保护相关证书：可能还包括其他环境保护方面的认证证书，例如环境影响评价报告、排污许可证等。

环境管理体系文件：除了认证证书外，还可能需要查看施工单位的环境管理体系文件，包括环境政策、环境目标与计划、环境管理程序等，以确保其符合相关标准和规定。

合规性文件：可能需要检查施工单位对环境法规和标准的遵守情况，包括环境保护法律法规的合规性文件。

环保设施和措施：此外，也可能需要检查施工现场的环保设施和措施，例如废水处理设施、噪音防治设施等，确保施工活动对环境的影响得到有效控制。